Zotero permet de gérer une base de données bibliographique très facilement. Il fonctionne sur tous les systèmes en tant que plugin dans “firefox”. Les références bibliographiques sont présentées dans une arborescence qui permet le classement dans des "collections".
L'alimentation des "collections" de références se fait très simplement directement à partir des sites web. De nombreux sites sont compatibles : pubmed, amazon, nature, plos… (http://www.zotero.org/translators/ ).
Zotero permet l'insertion de références dans les logiciels de traitement de texte "Microsoft Word" ou "OpenOffice.org". Les références insérées sont numérotées et formatées avec le style bibliographique de son choix. De nombreux styles sont disponibles (http://www.zotero.org/styles ).
Chaque référence bibliographique dans Zotero peut contenir des URLs, des notes, des liens vers les fichiers PDF (possibilité de télécharger automatiquement les fichiers PDF). La base de données peut aussi stocker les fichiers PDF eux mêmes.
Les collections de références peuvent être formatées directement par Zotero dans des fichiers texte de type RTF ou HTML.
Zotero permet d'importer les bibliographies dans les formats : MOD, BibTex, RDF, RIS, MARC, REFER
et d'exporter dans les formats : BibTex, Zotero RDF, MOD, RIS, REFER, wikipedia citations
J'utilise Zotero quotidiennement, ainsi que plusieurs collègues du laboratoire, pour faire ma bibliographie. J'apprécie sa facilité d'installation, d'utilisation et les possibilités d'export des collections en RTF.
Zotero stocke l'ensemble de ses réglages, des fichiers et la base de données dans un seul répertoire (par défaut dans le profile utilisateur de Firefox). Un point très intéressant est que l'on peut facilement placer ce répertoire où l'on veut, on peut le sauvegarder, le mettre sur une clé USB pour le transporter chez soi... très pratique.
Les développements prévus sont très intéressants : partage de sa base de données sur internet, alimentation par flux RSS...
L'importation des fichiers de bibliographie provenant d'autres logiciels peut parfois se révéler compliquée. Suivant le logiciel d'origine, sa version, l'export aux formats d'échanges (bibtex, reference manager) est plus ou moins bien faite (problème d'encodage des caractères, séparation des auteurs dans les champs...).
Zotero n'est pas encore compatible avec le site web "ISI Web of Knowledge" (en cours de développement).
Enfin, Zotero tous les styles de bibliographie ne sont pas pris en charge ( http://www.zotero.org/styles ). Il est possible de créer un nouveau style ( voir la page http://www.zotero.org/support/dev/creating_citatio... ), mais ceci nécessite encore des connaissances en XML.

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Commentaires
Blogs sur Zotero
Deux blogs à signaler sur Zotero :
celui du projet sur : http://www.zotero.org/blog/
et un nouveau blog francophone :
http://zotero.hypotheses.org/ sur la plateforme "Hypothèses. Carnets de recherche en Sciences humaines" : http://hypotheses.org/
Essai de Zotero sur mac par un chimiste utilisateur de Sente
Points positifs :
Une grande facicité d'utilisation : la fenêtre de Firefox peut se couper en deux pour montrer une interface de base de données. Quand on ouvre la page web d'un article (je l'ai testé avec Elsevier), on clique sur un bouton, et le logiciel rempli la fiche, télécharge le PDF et le classe sur le disque dur.
L'intégration avec Word (à la manière de EndNote ou Sente, de manière plus simple qu'EndNote). On insère des références dans le manuscript et on crée une liste de références à la fin du manuscript en un clic. On peut changer le style de citation plus tard.
La liste de styles de citation (format bibliographiques dans le texte et dans la liste de références à la fin du manuscript) disponibles est très longue :
http://www.zotero.org/styles
(y compris ACS, Chem of Mater... mais il manque les journaux de catalyse / matériaux / membranes...)
Une très abondante et très claire documentation (vidéo, etc.), bien organisée sur leur site. Voyez :
http://www.zotero.org/support/guide_de_demarrage_r...
La vidéo qui montre l'intégration avec MS Word (en anglais) :
http://www.zotero.org/support/zotero_and_word
La page générale de support : http://www.zotero.org/support/
En plus, il semble (à voir les exemples de documents) que la participation française dans le projet soit notable.
Une rapidité étonnante pour un plug-in de Firefox (même sur un mac de janvier 2003).
Une version future 1.5 (l'actuelle est 1.07) qui est proche de la sortie, et qui répondrait aux remarques négatives ci-dessous (en particulier l'extraction automatique des données biblio à partir des articles en PDF comme le fait Sente).
Il proposeront aussi le partage des bibliothèques sur un serveur central ou entre des machines individuelles sur un réseau, ce qui est une demande que l'on entend souvent lors de discussions sur EndNote.
Gratuité. (!)
Aspects perfectibles :
- l'emplacement des fichiers PDF que Zotero range sur le disque dur n'est pas négociable en dehors du choix du dossier de base (pas de tri selon le journal, l'année, l'auteur ou autre, comme dans Sente). Cela ne gênera sans doute que peu de gens.
- La création de nouveaux styles de citation semble compliquée, bien que basée sur le language ouvert CSL.
Inconvénient :
Le logiciel ne sait pas (actuellement) lire directement les données bibliographiques d'un article en PDF (à la manière de Sente) : si on glisse un article en PDF sur la base de données, il faut saisir à la main les références (auteurs, titre, etc.). C'est une grande source d'erreur et ça ralentit beaucoup le travail. Si vous avez l'habitude de recevoir des articles en PDF par email de la part de collègues ou autres (mon cas), c'est pénible.
Il semble toutefois possible d'importer des fichiers de références RIS ou TXT (directement depuis le web), mais alors il faut ajouter le PDF à la main. On revient à la lenteur d'EndNote...
limitations de Zotero
Si le moteur de recherche et d'archivage des données bibliographiques est extrêmement performant et facile à utiliser, il n'en est pas de même pour les différents plugins permettant d'insérer une citation dans un document:
1) Le plugin pour OpenOffice manque de stabilité.
2) Il n'est pas possible de créer son propre style de citation facilement car il n'existe pas d'interface graphique pour le faire.
Hors mis ces deux points ce projet est a suivre de prêt car il est en avance sur la concurrence dans bien des domaines.
PP
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