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Minbrkpts
Fiche dév Ens Sup - Recherche
Développement de la communauté de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche
Création ou MAJ importante :
15/09/08
Correction mineure :
03/11/08
Auteur :
Teresa Gomez-Diaz
(IGM-LabInfo)
Responsable thématique :
Violaine Louvet
(Institut Camille Jordan)
Mots-clés
Laboratoire :
IGM-Labinfo
Tutelle :
CNRS
,
ESIEE
,
UPEMLV
Système :
UNIX-like
Métier-activité :
biologie
,
développeur
Domaine informatique :
métier
Usage :
informatique perso
Mots-clés proposés par l'auteur :
carte génétique
,
ordre partiel
Minbrkpts : tests des performances d'une heuristique permettant la linéarisation d'ordres partiels
Ce logiciel a été développé dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
Site web
Système :
UNIX-like
Version actuelle : minbrkpts-1.0.0 - septembre 2006
Licence(s) : choix en cours, contacter l'auteur - Distribution à la demande.
Etat : utilisé en interne
Support : non maintenu, pas de développement en cours
Concepteur(s) : Pierre Guillon, Guillaume Blin
Contact concepteur(s) : Pierre.Guillon @ univ-mlv.fr
Laboratoire(s) :
IGM-Labinfo
Fonctionnalités générales du logiciel
Linéarisation d'ordres partiels
Contexte d’utilisation du logiciel
Obtention de résultats de complexité et étude algorithmique du problème de la linéarisation d'ordres partiels. Validation des résultats de recherche des articles publiés.
Publications liées au logiciel
Guillaume Blin, Eric Blais, Pierre Guillon, Mathieu Blanchette, and Nadia El-Mabrouk. Inferring gene orders from gene maps using the breakpoint distance. In, Guillaume Bourque, Nadia El-Mabrouk, editors, 4th Annual RECOMB Satellite Workshop on Comparative Genomics (RECOMB-CG'06). vol. 4205. LNBI. Montreal, Quebec. September 2006. pp. 99--112 Springer-Verlag.
Guillaume Blin, Eric Blais, Danny Hermelin, Pierre Guillon, Mathieu Blanchette, and Nadia El-Mabrouk. Gene maps linearization using genomic rearrangement distances. Journal of Computational Biology. Vol. 14. (4). 2007. pp. 394--407.