Thème : biologie

Le thème biologie a pour objectif de regrouper les fiches de logiciels (ainsi que d'autres informations relatives à des logiciels) utilisés dans les laboratoires de recherche et dans les enseignements en biologie. La thématique biologie se décline en trois groupes principaux: l'analyse de séquence, la bioinformatique structurale, l'intégration de données hétérogènes.

Les moyens informatiques utilisés vont du poste de travail individuel (pour ses possibilités de visualisation avancée et ses navigateurs internet) au serveur de calcul multiprocesseur, certains problèmes demandant des calculs intensifs. La plupart des logiciels sont disponibles en environnement Unix (gnu/linux en particulier).

Le principal mot-clé PLUME pour ce thème est : métier-activité = biologie

Les responsables du thème sont Christelle Dantec (Centre de Recherche de Biochimie Macromoléculaire, Montpellier), Christophe Caron (Station Biologique de Roscoff) et Laurent Perochon (UMR Métafort), plus particulièrement en charge de la sous thématique agronomie. Emmanuel Courcelle (LIPM) a également été en charge de ce thème : merci à lui pour ses actions (qui continue pour lui dans PLUME !).

 

Sur ce thème, vous pouvez afficher les différentes informations référencées dans PLUME

Fiche Logiciel Les logiciels validés (ou à valider, en tests)

Fiche Dev ESR Les développements Enseignement Supérieur Recherche

Fiche ressource Les ressources

Vous pouvez vous abonner au fil RSS biologie qui annonce tous les objets PLUME (fiches logiciels, dév ESR, brèves...) avec le mot-clé biologie.

 

Plus détaillé, voici un classement des principaux logiciels correspondant à ce thème dans PLUME

Attention, la liste ci-dessous, réalisée en mars 2010, n'est pas exhaustive

 

Autres thèmes principaux dans PLUME ...

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Journée logiciels biologie

Une journée PLUME aura pour thème 'Logiciels issus de la recherche publique utilisés dans les sciences de la vie'. Elle aura lieu à Montpellier (campus CNRS) le 15 mai 2012 : programme et les modalités d'inscription.