Monolix

Fiche logiciel validé
  • Création ou MAJ importante : 15/10/10
  • Correction mineure : 23/08/13
Mots-clés
Pour aller plus loin
  • Fiches logiciel PLUME connexes : Cmake

Monolix : analyse de modèle non-linéaire à effets mixtes

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Description
Fonctionnalités générales

Monolix (pour MOdèles NOn LInéaires à effets miXtes) est un logiciel permettant l'estimation de paramètres de modèles mathématiques analytiques ou basés sur un système d'équations différentielles ordinaires dans un contexte populationnel. Le logiciel permet l'estimation des paramètres moyens dans une population d'individus ainsi que des caractéristiques des distributions aléatoires associées aux paramètres. Le domaine d'application principal est la pharmacocinétique et la pharmacodynamie des médicaments.

De nombreuses fonctionnalités sont implémentées dans Monolix :

  • estimation des paramètres du modèle avec SAEM ;
  • estimation de la vraisemblance du modèle par échantillonnage préférentiel ;
  • sorties graphiques et numériques ;
  • simulation de données ;
  • librairies de modèles (pharmacocinétiques, pharmacodynamiques, dynamiques virales).
  • MLXTRAN est un traducteur intégré à Monolix qui permet à l'utilisateur d'écrire son modèle, en particulier lorsqu'il est défini par un système d'équations différentielles ordinaires.

Contexte d'utilisation dans mon laboratoire/service

Dans le cadre de leurs recherches en pharmacologie à L'INSERM-P7 ainsi qu'à l'INRA en agronomie, génétique animale et micro-biologie.
Ce logiciel est aussi utilisé et sponsorisé par de grands groupes pharmaceutiques tels que : Johnson & Johnson, Roche, Sanofi aventis, Exprimo et Novartis.

Limitations, difficultés, fonctionnalités importantes non couvertes
  • Il n'existe actuellement pas de version serveur du logiciel.
  • il n'existe pas de version script (obligation d'utiliser le GUI)
Environnement du logiciel
Plates-formes

Unix-like, Windows et Mac OS X.

Logiciels connexes
Autres logiciels aux fonctionnalités équivalentes
  • Nonmem : logiciel équivalent à ceci près qu'il est payant. et que les algorithmes implémentés sont moins performants (basés sur une linéarisation du modèle)
Environnement de développement
Type de structure associée au développement
Eléments de pérennité

Monolix est sponsorisé par plusieurs grands groupes pharmaceutiques et 4 ingénieurs sont embauchés à temps plein sur son développement.

Environnement utilisateur
Liste de diffusion ou de discussion, support et forums
Documentation utilisateur

Commentaires

Responsable thématique précédent

Cette fiche a d'abord été suivie par le responsable thématique Violaine Louvet. Clive Ferret-Canape l'a reprise en juillet 2013.

Reprise par la société Lixoft

Bonjour,

La société Lixoft est en charge du développement de Monolix depuis 2011. Monlix n'est plus un logiciel open source mais il reste gratuit pour les académiques. La version 4.2 est sortie.

Clive