R-commander est une interface graphique pour le logiciel R. Elle facilite l'apprentissage de ce langage de programmation en offrant à l'utilisateur la possibilité de réaliser l'importation de données, un certain nombre de traitements statistiques élémentaires ou plus avancés, l'export des résultats de manière interactive tout en indiquant les commandes R correspondantes. Des greffons peuvent être ajoutés pour réaliser d'autres traitements statistiques.

• Importation de données :
  • depuis un fichier texte ; par copier-coller ; par URL (Windows, Mac, Linux)
  • depuis des fichiers Excel, Access, dBase, SPSS, SAS, Minitab, STATA (Windows)
  • depuis un paquet R
• Manipulation des données (sélection, réorganisation, édition directe, recodage...)
• Traitements statistiques :
  • statistiques descriptives : moyenne, médiane, tableau de contingence
  • tests paramétriques (tests t, ANOVA) et non paramétriques (Wilcoxon, Kruskal et Wallis)
  • analyse de données : analyse en composantes principales, analyse factorielle, analyse discriminante, classification
  • modélisation : régression linéaire, régression logistique simple, multinomiale et ordinale, modèles linéaires généralisés
• Représentations graphiques :
  • diagramme en barres, en points, camembert, boîte à moustaches, histogramme, comparaison de quantiles...
  • diagnostics de modèles
  • les graphiques peuvent être copiés ou exportés dans un format vectoriel pour une meilleure qualité d'impression
• Probabilités, courbes de répartition et données aléatoires à partir de nombreuses distributions.
• Une trentaine de greffons disponibles fournissent d'autres possibilités d'analyses : analyse de durée/survie, analyse de données « à la française », analyse textuelle...

Importation depuis plusieurs formats courants ; exportation au format CSV ou TSV.