Les fiches DevESR suivies par le responsable thématique CDantec
Dans le projet PLUME, chaque responsable thématique a en charge un certain nombre de fiches qu'il n'a pas rédigées mais qu'il suit (contact direct avec l'auteur, relecture, mise à jour...).
Logiciel | Description | Etat | Langue |
---|---|---|---|
Ed'Nimbus |
DNA sequence filtering |
![]() |
![]() |
NemoFish |
three-dimensional fluorescence in situ hybridization (3D-FISH) |
![]() |
![]() |
pyQPCR |
analysis of real-time quantitative PCR data supplying relative quantifications |
![]() |
![]() |
Narcisse |
navigateur de génomes comparés |
![]() |
![]() |
GAGG |
algorithme (codé en R) qui permet le clustering de gènes |
![]() |
![]() |
pyQPCR |
traiter les données de PCR quantitative pour obtenir les quantifications relatives ou absolues |
![]() |
![]() |
GAGG |
algorithm (R code) allowing gene clustering |
![]() |
![]() |
FactoMineR |
package du logiciel R dédié à l'analyse de données |
![]() |
![]() |
Narcisse |
compared genomes browser |
![]() |
![]() |
BioMAJ |
mise à jour et transformation automatique de banques biologiques |
![]() |
![]() |
Chemotaxis |
approximation of PDEs models (parabolic, hyperbolic and kinetic models) |
![]() |
![]() |
EZ-Rhizo |
analyse de l'architecture racinaire de plantes en boite de Pétri |
![]() |
![]() |
EDNA |
environnement pour réaliser des programmes d'analyses de données en ligne |
![]() |
![]() |
Free-D |
reconstruction, visualisation et analyse de modèles 3D générés à partir d'images 2D ou 3D (biologie) |
![]() |
![]() |
Stockoptions |
gestionnaire de containers virtuels pour le laboratoire |
![]() |
![]() |
MixNet/MixeR |
statistiques : Mixture Models for Networks |
![]() |
![]() |
Molecular Modelling Toolkit |
bibliothèque de simulation moléculaire |
![]() |
![]() |
DomainFinder |
détermination et caractérisation des domaines dynamiques dans les protéines |
![]() |
![]() |
Minbrkpts |
performance testing of heuristics for the linearization of partial orders |
![]() |
![]() |
BioRica |
décrire et simuler les systèmes multi-modèles en biologie |
![]() |
![]() |
EDNA |
framework for plugin-based applications for online data analysis |
![]() |
![]() |
QTLMap |
détection de QTL dans les populations animales expérimentales |
![]() |
![]() |
QTLMap |
detection of QTL from experimental designs in outbred population |
![]() |
![]() |
TASE |
outil en ligne permettant la recherche de régions candidates par analyse de données SNP |
![]() |
![]() |
pDynamo |
modélisation moléculaire et simulation des protéines |
![]() |
![]() |
ANISEED |
modélisateur du développement de l'ascidie |
![]() |
![]() |
ANISEED |
representing and modeling the ascidian development |
![]() |
![]() |
TASE |
online tool for searching candidate regions from SNPs data |
![]() |
![]() |
serial cloner |
manipuler & visualiser des séquences d'ADN, préparer des projets de clonage |
![]() |
![]() |
Ed'Nimbus |
filtre de séquences ADN |
![]() |
![]() |
Minbrkpts |
tests des performances d'une heuristique permettant la linéarisation d'ordres partiels |
![]() |
![]() |
SODA |
dessin des oligonucléotides pour la méthode de clonage SLIC |
![]() |
![]() |
ESPript |
visualisation d'alignements multiples corrélés à la structure secondaire |
![]() |
![]() |
NemoFish |
analyse d'image pour les gènes et territoires chromosomiques en FISH 3D |
![]() |
![]() |
EuGène |
prédicteur de gènes pour les organismes eucaryotes et procaryotes |
![]() |
![]() |
PFIM |
evaluation et optimisation de protocoles de population |
![]() |
![]() |
myProMS |
validation, quantification et partage des données de spectrométrie de masse protéomique |
![]() |
![]() |
T-lex |
annotation d'éléments transposables à partir de données de séquençage (NGS) |
![]() |
![]() |
PFIM |
population design evaluation and optimisation |
![]() |
![]() |
X!TandemPipeline |
filtrage, édition, regroupement de résultats d'identifications MS |
![]() |
![]() |
SVDetect |
detection de variants structuraux à partir de lectures haut-débit appariées |
![]() |
![]() |
X!TandemPipeline |
edit, filter, merge and group your peptide/protein identifications from MS/MS mass spectra |
![]() |
![]() |
GesCommLab |
gestion des commandes pour laboratoires de la fonction publique |
![]() |
![]() |
SVDetect |
a tool to detect genomic structural variations from paired-end and mate-pair sequencing data |
![]() |
![]() |
ScientiFig |
création ou (re)formatage de figures pour les communications scientifiques |
![]() |
![]() |
ScientiFig |
create publication-ready scientific figures |
![]() |
![]() |