Les fiches logiciel suivies par le responsable thématique manu

Dans le projet PLUME, chaque responsable thématique a en charge un certain nombre de fiches qu'il n'a pas rédigées mais qu'il suit (contact direct avec l'auteur, recherche de relecteurs, relecture, mise à jour...).

Logicielicone de tri Description Workflow MAJ majeure
Wt framework en C++ pour développer des interfaces graphiques pour applications web Fiche logiciel Publié - A valider
WinMDI analyse des données de cytométrie (biologie) Fiche logiciel Publié 04/10/2011
Vector NTI gestion et analyses de molécules biologiques (ADN ou protéines) Fiche logiciel Archivé 22/10/2008
Valgrind débogueur spécialisé dans la gestion de la mémoire Fiche logiciel Publié 16/02/2012
THESIAS génétique statistique : test d'association haplotypes - phénotype chez des individus non apparentés Fiche logiciel Publié 26/09/2011
Taverna Conception de workflows et moteur d'exécution Fiche logiciel Publié 12/10/2011
SNPTEST analyses d’association “génome-entier” à partir de SNPs Fiche logiciel Publié - A valider 06/05/2009
SHELX résolution et affinement de structures cristallographiques Fiche logiciel Publié 07/02/2012
samtools Manipuler des alignements au format SAM/BAM (biologie) Fiche logiciel En MAJ 20/01/2012
Ruby langage de script orienté objet Fiche logiciel Publié 27/02/2012
python langage multi-paradigme et multi-usage Fiche logiciel Publié 12/09/2013
PLINK analyse de type "génome-entier" Fiche logiciel Publié - A valider 06/05/2009
pDRAW32 outil de biologie moléculaire (annotations, analyse, clonage, restriction enzymatique) Fiche logiciel Publié 04/10/2011
Mobyle framework pour intégrer les logiciels bioinformatiques Fiche logiciel Publié 16/04/2012
lucene moteur d'indexation et de recherche Fiche logiciel Publié 28/01/2013
IMPUTE estimation des génotypes de SNPs non directement génotypés par des instruments Fiche logiciel Publié - A valider 06/05/2009
ImageJ analyse d'images multiplateformes Fiche logiciel Publié 14/05/2013
GBrowse Generic Genome Browser : visualisateur d’informations à l’échelle génomique Fiche logiciel Publié 20/01/2012
Galaxy plateforme pour analyser les données génomiques Fiche logiciel MAJ Relue par RT 02/10/2011
ergatis moteur de workflow Fiche logiciel Publié 16/02/2012
EMBOSS suite logicielle pour les analyses bioinformatiques Fiche logiciel MAJ Relue par RT 26/09/2011
Emacs éditeur de texte Fiche logiciel Publié 26/10/2013
Cytoscape visualisation et analyse des réseaux d’intéraction Fiche logiciel Publié 26/10/2013
CraneFoot visualisation graphique d'arbres familiaux (pedigree) Fiche logiciel Publié - A valider 24/12/2009
Coot modélisation et validation de structures de protéines Fiche logiciel Publié 11/10/2011
circos visualisation synthétique de données de génomique comparée (ou tout autre réseau) Fiche logiciel MAJ Relue par RT 05/10/2011
chimera visualisation de protéines, petites molécules... Fiche logiciel Publié 03/05/2012
BLAST comparaison de séquences nucléiques ou protéiques Fiche logiciel En MAJ 11/07/2011
BioPerl bibliothèque Perl de modélisation et traitement de données de biologie Fiche logiciel MAJ Relue par RT 24/10/2011
BASE stockage et analyse de données de puces à ADN Fiche logiciel Publié 02/12/2011
Apollo visualisation et édition d'annotations génomiques Fiche logiciel Publié 31/08/2012
APE éditeur d'ADN en général et plasmides en particulier Fiche logiciel Publié 07/03/2013