• Reconstitution tri-dimensionnelle statistique et exhaustive d'objets biologiques à partir de piles d'images (p.ex. coupes histologiques)
• Calcul de densité de présence d'objets dans un territoire 3D
• Représentations tri-dimensionnelles d'objets et de moyennes d'objets
• Représentations tri-dimensionnelles et de cartes de densité d'objets dans un volume
• 2D -> 3D

• Traitement des métadonnées
• Segmentation et pointage
• Comptage d'objet

Format des images : tiff ; le logiciel génère des descripteurs (métadonnées) donc ne modifie pas les images. il produit des fichiers ".txt" ainsi que des images des modèles (format .png).

L'utilisation principale de Free-D dans notre équipe est la reconstitution tri-dimensionnelle de régions du système nerveux central à partir des données obtenues par l'immunohistochimie. Le logiciel est aussi bien utilisé par des chercheurs que des ingénieurs, techniciens ou doctorants. Très simple d'utilisation, les fichiers d'aide sont bien documentés. Notre équipe de recherche travaille à produire une cartographie statistique et exhaustive des motifs d'activation dans le cerveau en réponse à des stimulations d'origine digestive. Facile à manipuler et intuitif, Free-D nous a permis d'établir des cartes d'activation neuronale précises à partir de données provenant de plusieurs animaux.

Des outils statistiques avancés intégrés sont manquants (notamment des tests statistiques d'objectivisation de recouvrement de territoires tri-dimentionnels)