R

Fiche logiciel validé
  • Création ou MAJ importante : 28/05/13
  • Correction mineure : 10/06/13

R : analyse statistique et réalisation de graphiques

Description
Fonctionnalités générales

R est à la fois un langage de programmation et un logiciel pour l'analyse statistique et la réalisation de graphiques.

  • R permet de gérer et stocker des données.
  • R est un langage interprété qui permet les embranchements et les boucles.
  • Il existe de nombreux modules (packages) contenant des fonctions statistiques prédéfinies, comme les modèles linéaires et linéaires généralisés, les modèles de régression non-linéaire, l'analyse de séries temporelles, les tests de classification paramétriques et non-paramétriques, les méthodes de groupement et de lissage, les statistiques spatiales, les valeurs extêmes...
  • Les résultats obtenus par les calculs statistiques sont stockables, exportables et réutilisables dans des fonctions.
  • On peut exporter les graphiques sous divers formats (image ou forme vectorielle).
Autres fonctionnalités
  • La plupart des routines R sont écrites en R.
  • Les routines écrites pour S plus (logiciel équivalent commercial) sont généralement valables en R.
Interopérabilité
  • De nombreux packages de R sont directement issus d'autres logiciels ou langages (WinEdt, Perl, Tlc/Tk, Python, Winbugs...)
  • Le projet Bioconductor (http://www.bioconductor.org/) propose de nombreux packages dédiés à l'analyse de données biologiques.
  • R peut être utilisé depuis SAGE
Limitations, difficultés, fonctionnalités importantes non couvertes
  • Messages d'erreur parfois obscurs...
  • Gourmand en mémoire
Environnement du logiciel
Distributions dans lesquelles ce logiciel est intégré

Distributions linux

Plates-formes
  • GNU/Linux
  • Mac OS X
  • Windows 95 et versions suivantes.
    Aide en anglais, interface graphique sur Windows en français et en anglais.
Logiciels connexes
Autres logiciels aux fonctionnalités équivalentes
  • S plus, logiciel commercial.
  • SAS, logiciel commercial.
  • ROOT.
Environnement de développement
Eléments de pérennité
  • Largement utilisé, existence depuis 1997.
  • Les conférences annuelles depuis 2006.
  • R-journal.

R a été validé par la Food Drug Administration (fin 2008). Il peut donc être utilisé dans le cadre des études cliniques visant la mise sur le marche de nouveaux médicaments. SAS n'est donc plus le seul logiciel officiellement valide.

Le dossier de certification est disponible ( http://www.r-project.org/doc/R-FDA.pdf ).

Environnement utilisateur
Liste de diffusion ou de discussion, support et forums
Documentation utilisateur
Divers (astuces, actualités, sécurité)

Portail Web (exécuter R depuis internet) http://www.math.montana.edu/Rweb/

Contributions

Il est possible de réaliser et de soumettre ses propres packages.