Free-D
Fonctionnalités générales du logiciel
Free-D est un logiciel conçu pour reconstituer et analyser, sous la forme de modèles géométriques tridimensionnels, des structures biologiques à partir de séries d'images de coupes physiques ou virtuelles. Il couvre des domaines d'applications variées, de l'échelle ultra-structurale jusqu'à celle des tissus et des organes.
Free-D intègre au sein d'une unique interface utilisateur l'ensemble des fonctionnalités requises pour la production et l'analyse des modèles 3D:
- Visualisation et navigation dans les piles d'images 2D et images 3D (séries d'images de coupes histologiques, images de microscopie confocale, IRM, etc.).
- Pointage et détourage de structures d'intérêt dans les images: segmentation d'images en mode manuel ou automatisé (seuillage d'histogramme+suivi de contour, contours actifs, détection de spots en 3D).
- Recalage d'images (application de transformations géométriques permettant de retrouver les correspondances anatomiques point à point entre images consécutives au sein d'une pile).
- Reconstruction de surfaces à partir de contours et visualisation interactive de modèles 3D des structures d'intérêt.
- Analyse quantitative des modèles 3D (comptages, calculs de barycentres, d'aires de contours et de surfaces, de volumes inclus dans des surfaces).