Nemo (un autre logiciel NEMO est décrit dans PLUME, nous obligeant d'identifier par NemoFish notre logiciel pour Plume) est un logiciel d'analyse d'images permettant de détecter chromosomes, gènes, ARN et autres séquences marquées dans des noyaux cellulaires acquis en microscopie confocale (3D). Nemo propose une détection automatique, semi-automatique ou manuelle des objets, il fournit un certain nombre de caractéristiques pour chaque objet détecté (coordonnées de l'isobarycentre, volume, surface, compacité,distance de feret) ainsi que plusieurs distances pour chaque paire d'objets (distance centre à centre, bord à bord, bord à centre, angles via le centre du noyau, % de colocalisation). L'ensemble des mesures peut être stocké dans une base de données MySQL interrogeable via une interface dédiée.