pDRAW32 : outil de biologie moléculaire (annotations, analyse, clonage, restriction enzymatique)

Fiche PLUME
  • Création ou MAJ importante : 04/10/2011
  • Correction mineure : 11/09/2012
  • Auteur : Sébastien Wieckowski - Faculté de Biologie et de Médecine (Université de Lausanne)
  • Responsable thématique : Emmanuel Courcelle (LIPM)
  • Relecteur 1 : Nemo Peeters
  • Relecteur 2 : Isabelle Bourgait
Mots clés
Description
Fonctionnalités générales

pDRAW32 est un outil de biologie moléculaire qui permet :

  • annotations des cartes de plasmide

    • gènes ou régions
    • directions
    • sites de restriction
    • linéarité
    • %GC
  • clonage virtuel

    • définition bidirectionnelle des fragments (jusqu'à 3 fragments)
    • gel virtuel
  • analyse de séquence

    • ORF avec code génétique multiple
    • primers
    • methylation
    • site de restriction
  • édition de séquence

    • propriétés
    • correction de séquence
    • inversion/rotation
    • recherche
  • graphique d'homologie 2D intra ou inter-séquence

  • calcul des paramètres pour les primers

Autres fonctionnalités
  • Format multiple de présentation, d'impression et de copié/collé
  • Mises à jour du fichier d'enzymes de restriction
  • En supplément, un petit guide scientifique au format HTMLHelp
Interopérabilité

Exportation au format Windows Metafile pour modifications complémentaires
Importation depuis VectorNTI

Contexte d'utilisation dans mon laboratoire/service

Utilisations au laboratoire pour la préparation des clonages et diverses analyses de séquences nucléotidiques (reverse-complement, translation)

Limitations, difficultés, fonctionnalités importantes non couvertes
  • Il n'y a pas d'outil de recherche automatisée de primers optimaux
  • Pas de gestionnaire de séquences (plasmides et primers)
  • Capacités d'alignement de séquences très limitées (XY plot)
Environnement du logiciel
Distributions dans lesquelles ce logiciel est intégré

Windows 95, 98, ME, NT4, 200, XP, Vista et 7

Plates-formes

WINE
CrossOver
VirtualPC

Autres logiciels aux fonctionnalités équivalentes
Environnement de développement
Eléments de pérennité

pDRAW32 est toujours en développement (dernière MAJ 17/04/2011)

Environnement utilisateur
Liste de diffusion ou de discussion, support et forums

http://www.acaclone.com/forum/
acaclone [at] hotmail [dot] com