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Version : pas de version
Extension : .fq, .fastq, _sequence.txt (Illumina)
Type de document : Fichier texte
Document de standardisation :
Un article (dans N.A.R.) décrivant le format
Page descriptive sur le site de Wikipedia
Description sur le site MAQ
Description courte :
Format qui permet de représenter un ou plusieurs séquences avec leurs scores de qualités par base. Une séquence est représentée par 4 lignes:
La première ligne commence par le symbol '@' suivi d'un identifiant de séquence.
La seconde ligne correspond à la séquence
La troisième ligne commence par '+' suivi d'éventuelles autres infos
La quatrième ligne correspond à la séquence qualité de la 2e ligne.
Exemple :
@HWI-QMN273:4:1:2:779#0/1 ANCAAAATCTGCATTACCTCCTCGGCTGGGACAACTTTATTC +HWI-QMN273:4:1:2:779#0/1 \D[aaaab_aaaabba__a^Za^aaZa`]a__a_Z_aaaa`\
Avantages :
Inconvénients :
Logiciels de traitement les plus connus :
Format connexe :