pDynamo

Fiche dév Ens Sup - Recherche
  • Création ou MAJ importante : 15/02/11
  • Correction mineure : 15/02/11
Mots-clés

pDynamo : modélisation moléculaire et simulation des protéines

Ce logiciel a été développé (ou est en cours de développement) dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
  • Site web
  • Système : UNIX-like, MacOS X
  • Version actuelle : 1.5.0 - 16/07/2010
  • Licence(s) : CeCILL-B
  • Etat : diffusé, stable
  • Support : maintenu, développement en cours
  • Concepteur(s) : Martin J. Field
  • Contact concepteur(s) : martin.john.field@gmail.com
  • Laboratoire(s), service(s)... : IBS, Pittsburgh Supercomputing Center

 

Fonctionnalités générales du logiciel

pDynamo est un logiciel de modélisation moléculaire écrit en Python et en C. Il est conçu pour faire les simulations des protéines et des autres macromolécules biologiques en utilisant les potentiels hybrides de la chimie quantique et de la mécanique moléculaire.

Contexte d’utilisation du logiciel

Modélisation de la dynamique et de la réactivité des protéines.

Publications liées au logiciel