Catégories de logiciels utilisés dans la recherche en chimie
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Dessin de molécules en 2D
- ChemSketch : logiciel Pro en licence académique
- bkchem
- chemtool
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Visualisation de protéines
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Éditeur / visualiseur de molécules en 3D
- Pymol : visualiseur open source pour les (bio-) molécules
- Avogadro : un des éditeurs 3D open-source les plus aboutis
- Gabedit : visualiseur de résultats de simulation DFT & ab-initio
- Jmol : à embarquer dans une page web
- Mercury : pour les structures cristalines
- Chimera : visualisation protéines, petites molécules...
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Modélisation moléculaire (optimisation 3D,calculs ab-initio, DFT, ...)
- OpenBabel: boite à outils pour logiciels de chimie
- Molecular Modelling Toolkit : bibliothèque de simulation moléculaire
- HuLiS : méthode Hückel simple et mésomérie
- TONTO : boite à outils de chimie computationnelle
- pDynamo : modélisation moléculaire et simulation des protéines
- NWChem
- BigDFT : ondelettes et cartes graphiques
- MOPAC2009 : licence académique
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Visualisation / Simulation spectroscopique (RMN, RPE, fluorescence ...)
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Visualisation scientifique (plot 2D / 3D):
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Gestion de stock de produits chimique et gestion de laboratoire
- ChemAzTech : logiciel de type chimiothèque
- intranet IsM2 : gestion de stock et de commandes de produits chimiques
- Chimithèque : gestion de stock de produits chimiques
- ChemProducts : Gestion de stock de produits chimiques
- MyChem: manipulation de données chimiques dans MySQL
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Cristallographie:
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Moteur de workflow d'analyse de données:
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Tableaux périodiques
- Kalzium : pour l'environnement KDE sous linux
- GPeriodic : pour l'environnement Gnome sous linux